MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 64128

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_011989	CAGC	2	8	121733	121740	25 %	0 %	25 %	50 %	222147121
2002	NC_011989	CTG	2	6	121774	121779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147121
2003	NC_011989	TAT	2	6	121828	121833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222147121
2004	NC_011989	TC	3	6	121851	121856	0 %	50 %	0 %	50 %	222147121
2005	NC_011989	CCAGGA	2	12	121896	121907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147121
2006	NC_011989	GGT	2	6	121962	121967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147121
2007	NC_011989	GCG	2	6	122072	122077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147121
2008	NC_011989	CGG	2	6	122252	122257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147121
2009	NC_011989	CAT	2	6	122340	122345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147121
2010	NC_011989	CCG	2	6	122376	122381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147121
2011	NC_011989	GGA	2	6	122466	122471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147121
2012	NC_011989	GCC	2	6	122516	122521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147121
2013	NC_011989	CGA	2	6	122541	122546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147121
2014	NC_011989	CAAAG	2	10	122550	122559	60 %	0 %	20 %	20 %	222147121
2015	NC_011989	CGC	2	6	122567	122572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147121
2016	NC_011989	GTC	2	6	122682	122687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147122
2017	NC_011989	ATCC	2	8	122723	122730	25 %	25 %	0 %	50 %	222147122
2018	NC_011989	CTT	2	6	122777	122782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147122
2019	NC_011989	CGT	2	6	122789	122794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147122
2020	NC_011989	TCC	2	6	122848	122853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222147122
2021	NC_011989	CTG	2	6	122895	122900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147122
2022	NC_011989	GTC	2	6	122904	122909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147122
2023	NC_011989	TC	3	6	122986	122991	0 %	50 %	0 %	50 %	222147122
2024	NC_011989	CAT	2	6	123009	123014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147122
2025	NC_011989	CA	3	6	123018	123023	50 %	0 %	0 %	50 %	222147122
2026	NC_011989	CTGG	2	8	123414	123421	0 %	25 %	50 %	25 %	222147123
2027	NC_011989	CGG	2	6	123425	123430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147123
2028	NC_011989	CGGG	2	8	123529	123536	0 %	0 %	75 %	25 %	222147123
2029	NC_011989	ACG	2	6	123538	123543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147123
2030	NC_011989	AAG	2	6	123547	123552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147123
2031	NC_011989	TGA	2	6	123558	123563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147123
2032	NC_011989	ATGA	2	8	123577	123584	50 %	25 %	25 %	0 %	222147123
2033	NC_011989	GGACG	2	10	123648	123657	20 %	0 %	60 %	20 %	222147123
2034	NC_011989	AAT	2	6	123762	123767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222147124
2035	NC_011989	CTGGC	2	10	123806	123815	0 %	20 %	40 %	40 %	222147124
2036	NC_011989	TACGAT	2	12	123832	123843	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	222147124
2037	NC_011989	GGC	2	6	123870	123875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147124
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2039	NC_011989	CGT	2	6	123948	123953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147124
2040	NC_011989	AGG	2	6	123968	123973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147124
2041	NC_011989	GAA	2	6	123981	123986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147124
2042	NC_011989	GCC	3	9	123991	123999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147124
2043	NC_011989	CGG	2	6	124002	124007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147124
2044	NC_011989	GAT	2	6	124020	124025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147124
2045	NC_011989	CGC	2	6	124032	124037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147124
2046	NC_011989	TCG	3	9	124058	124066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147124
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2048	NC_011989	TCTA	2	8	124142	124149	25 %	50 %	0 %	25 %	222147124
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2050	NC_011989	GCA	2	6	124219	124224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147124
2051	NC_011989	CCTG	2	8	124442	124449	0 %	25 %	25 %	50 %	222147125
2052	NC_011989	CACCG	2	10	124547	124556	20 %	0 %	20 %	60 %	222147125
2053	NC_011989	GAC	2	6	124622	124627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147125
2054	NC_011989	GAC	2	6	124646	124651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147125
2055	NC_011989	GGCT	2	8	124701	124708	0 %	25 %	50 %	25 %	222147125
2056	NC_011989	G	6	6	124736	124741	0 %	0 %	100 %	0 %	222147125
2057	NC_011989	GCG	2	6	124743	124748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147125
2058	NC_011989	TTGC	2	8	124779	124786	0 %	50 %	25 %	25 %	222147125
2059	NC_011989	CAA	2	6	124817	124822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147125
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2061	NC_011989	GCCT	2	8	124844	124851	0 %	25 %	25 %	50 %	222147125
2062	NC_011989	TGC	2	6	124979	124984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147125
2063	NC_011989	TGGCC	2	10	125120	125129	0 %	20 %	40 %	40 %	222147125
2064	NC_011989	CGG	2	6	125147	125152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147125
2065	NC_011989	CAC	2	6	125213	125218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147125
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2069	NC_011989	CGA	2	6	125378	125383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147125
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2072	NC_011989	TCG	2	6	125577	125582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147125
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2121	NC_011989	TGG	2	6	128667	128672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147129
2122	NC_011989	CCG	2	6	128691	128696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147129
2123	NC_011989	CTC	2	6	128713	128718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222147129
2124	NC_011989	GGT	2	6	128797	128802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147129
2125	NC_011989	GTC	2	6	128899	128904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147129
2126	NC_011989	GGA	2	6	128929	128934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147129
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2130	NC_011989	TCG	2	6	129059	129064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147129
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2135	NC_011989	TGCC	2	8	129735	129742	0 %	25 %	25 %	50 %	222147130
2136	NC_011989	GAT	2	6	129750	129755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147130
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2138	NC_011989	CGT	2	6	129826	129831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147130
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2140	NC_011989	TTCC	2	8	129936	129943	0 %	50 %	0 %	50 %	222147130
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2149	NC_011989	CGA	2	6	130374	130379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147130
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2151	NC_011989	GCA	2	6	130460	130465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147130
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2230	NC_011989	CGC	2	6	134809	134814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147134
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2238	NC_011989	GGGC	2	8	135147	135154	0 %	0 %	75 %	25 %	222147135
2239	NC_011989	GCC	2	6	135247	135252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147135
2240	NC_011989	CCGC	2	8	135345	135352	0 %	0 %	25 %	75 %	222147135
2241	NC_011989	GCG	3	9	135360	135368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147135
2242	NC_011989	CCA	2	6	135479	135484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147135
2243	NC_011989	CGG	2	6	135632	135637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147135
2244	NC_011989	CGG	2	6	135668	135673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147135
2245	NC_011989	GCA	2	6	135743	135748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147135
2246	NC_011989	GCC	2	6	135752	135757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147135
2247	NC_011989	CCT	2	6	135758	135763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222147135
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2353	NC_011989	GTT	3	9	141657	141665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147141
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2358	NC_011989	GAT	2	6	141882	141887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147141
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2360	NC_011989	TGCCGG	2	12	141905	141916	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222147141
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2362	NC_011989	GCC	2	6	142065	142070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147141
2363	NC_011989	TTG	2	6	142082	142087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147141
2364	NC_011989	ATC	2	6	142149	142154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147141
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2366	NC_011989	ACC	2	6	142245	142250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147141
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2382	NC_011989	CCGGTA	2	12	142618	142629	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222147141
2383	NC_011989	CGGAGA	2	12	142727	142738	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	222147141
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2474	NC_011989	TGC	2	6	147280	147285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147142
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2480	NC_011989	AT	3	6	147583	147588	50 %	50 %	0 %	0 %	222147142
2481	NC_011989	CCA	2	6	147780	147785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147142
2482	NC_011989	ATG	2	6	147789	147794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147142
2483	NC_011989	GC	3	6	147802	147807	0 %	0 %	50 %	50 %	222147142
2484	NC_011989	TGC	2	6	147940	147945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147142
2485	NC_011989	GTC	2	6	148010	148015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147142
2486	NC_011989	TGT	2	6	148042	148047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147142
2487	NC_011989	ATC	2	6	148193	148198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147142
2488	NC_011989	GCC	4	12	148199	148210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147142
2489	NC_011989	TCG	2	6	148230	148235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147142
2490	NC_011989	AT	3	6	148243	148248	50 %	50 %	0 %	0 %	222147142
2491	NC_011989	AT	3	6	148450	148455	50 %	50 %	0 %	0 %	222147142
2492	NC_011989	GTT	2	6	148508	148513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147142
2493	NC_011989	GTC	2	6	148533	148538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147142
2494	NC_011989	GCC	2	6	148915	148920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147143
2495	NC_011989	TGC	2	6	149034	149039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147143
2496	NC_011989	TGA	2	6	149103	149108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147143
2497	NC_011989	AT	3	6	149129	149134	50 %	50 %	0 %	0 %	222147143
2498	NC_011989	AT	3	6	149147	149152	50 %	50 %	0 %	0 %	222147143
2499	NC_011989	TGGT	2	8	149172	149179	0 %	50 %	50 %	0 %	222147143
2500	NC_011989	TAT	2	6	149188	149193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222147143

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